Jugando con el codigo introducido, encontraras personajes que te daran codigos como recompensa por haber terminado el juego Zelda Oracle of Seasons.

Cuando consigas los codigos en el Zelda Oracle of Ages, tienes que volver a la partida grabada que tenias del Zelda Oracle of Seasons (la partida que acabaste la primera vez) y encontrar los personajes a los que dar esos codigos. Al darselos recibiras regalos para esa partida y en muchas ocasiones otro codigo.

Esos otros codigos son para la partida nueva del Zelda Oracle of Ages (la que iniciaste usando la opcion Secretos). Tendras que darselos a una chica que hay en el interior del Arbol Maku y a cambio recibiras regalos para esa partida.

Cuando te acabes el juego Zelda Oracle of Ages habiendo introducido el codigo que te dan cuando terminas el Oracle of Seasons, te encontraras con enemigos finales que antes no estaban y veras un final diferente del juego.

Nota:
Los codigos conseguidos en uno y otro juego solo sirven para esas dos ediciones concretas, ya que estan interrelaccionados por medio del codigo que se consigue acabandolos por primera vez. Por ejemplo, si juegas al Zelda Oracle of Seasons usando el codigo que se consigue en el Zelda Oracle of Ages y consigues codigos, esos codigos solamente funcionaran en el Zelda Oracle of Ages que te dió el codigo para comenzar la segunda partida. Es decir que no funcionaran en cualquier edicion del Zelda Oracle of Ages.

Fuente: http://www.trucoteca.com